igital Devil Saga stanowi spin-off serii Shin Megami Tensei (podobnie jak Persona 3 i 4 wydane w kolejnych latach). W grze pojawił się ponownie turowy system walki "press turn", który został po raz pierwszy wprowadzony w Shin Megami Tensei: Nocturne. System ten wyróżnia się możliwością przekazywanie swojej kolejki ruchu innemu bohaterowi. W przypadku wykorzystania słabości adwersarza, gracz otrzymuje bonusową możliwość ruchu w swojej turze. W przeciwieństwie jednak do Nocturne w Digital Devil Saga można zmieniać wyekwipowane zestawy zdolności wedle życzenia gracza, a nie w momencie zdobywania wyższego poziomu doświadczenia. W przeciwieństwie do Nocturne, wyuczone zdolności bohaterów nie przepadają na zawsze, co pozwoliło Atlus na wprowadzenie znacznie bogatszych opcji personalizacji bohaterów. Skille odblokowywane są poprzez wykupywanie "Mantr" za walutę Macca. Zakupione umiejętności "ładujemy" poprzez dobywanie punktów Atma po zabiciu grup przeciwników.