Bakugan: Defenders of the Core to strategiczna gra akcji, kontynuacja gry karcianej Bakugan Battle Brawlers, bazującej na popularnym serialu anime.
Przed rozpoczęciem rozgrywki gracz tworzy postać swojego bohatera, który wyruszy w świat aby nieść pomoc upadającym metropoliom, atakowanym przez członków organizacji Vexos. W walce z oponentami pomagają mu tzw. Bakugany. Są to potężne istoty zamknięte w kulach, które przyjmują, po wyrzuceniu na pole bitwy, prawdziwą postać. Każdy z nich ma własną domenę mocy, czyli żywioł, w którym się specjalizuje. Tych ostatnich istnieje sześć: Pyrus to ogień, Haos to światło, Ventus to wiatr, Aquos to woda, Darkus to ciemność, Subterra to ziemia.
W odróżnieniu od pierwszej części cyklu, w Bakugan: Defenders of the Core starcia Bakuganów odbywają się w czasie rzeczywistym, co oznacza, że gracz ma pełną kontrolę nad pupilem swojego bohatera. Po zakończonych starciach rozgrywka sprowadza się do eksploracji świata gry w poszukiwaniu złych duchów wysysających ze świata życiową energię. W trakcie rozpoznawania okolicy, gracz musi zwrócić uwagę na specjalne lokacje, sekrety oraz ukrytych przeciwników. Pokonanie tych ostatnich zaowocuje odblokowaniem dostępu do ciekawych postaci niezależnych oraz dodatkowych poziomów.
Bakugan: Defenders of the Core pozwala na prowadzenie zabawy w trybie gry wieloosobowej, dla maksymalnie czterech graczy na podzielonym ekranie. Możliwe jest toczenie starć jeden-na-jeden, klasyczny deathmatch, a także tzw. Destruction Battles, charakteryzujące się większym przywiązaniem do strategii oraz taktyki. Grafika programu jest dopracowana, utrzymana w konwencji anime.