Syndrome to gra o tematyce sci-fi survival horror, akcja odbywa się na pokładzie „Valkenburg”, naukowego statku kosmicznego poszukiwawczego wyposażonego w najbardziej zaawansowane systemy we flocie Novacore.
Budzisz się oszołomiony i zdezorientowany, prawdopodobnie z powodu skutków kryośpiączki. Nie dostrzegasz nikogo wokół, ale wkrótce znajdujesz ciała zmarłych członków twojej załogi. Statek jest zagubiony, a ktokolwiek – czy cokolwiek – zabiło członków załogi jest prawdopodobnie wciąż gdzieś w pobliżu.
Twoim zadaniem jest dowiedzieć się, co się stało z twoją załogą i zrobić wszystko co możliwe, aby przetrwać ten koszmar. Wrogowie są liczni i potężni, więc podstęp i unikanie będą często twoją najlepszą strategią. Broń znajdziesz na pokładzie statku, ale uważaj, amunicja jest ograniczona, powinieneś jej używać rozsądnie.